(一)现行户籍制度存在的问题

(1)户籍制度和市场经济的发展要求不相适应。

在我国现行的户籍制度下，对人口的迁徙进行限制，人为的划分城市和农村两个人力资源市场，从而使得价格调整人力资源配置方面的作用弱化，降低了经济的效率。人口不能自由流动，实际上是提高了劳动力的使用成本。

(2)从结构优化的角度看，户籍制度限制人口自由流动也不利于产业结构的升级。现行的户籍管理制度限制了劳动力的自由流动。产业结构的优化需要打破现有的户籍制度，实现人力资源的自由流动。

(3)现行的户籍制度不利于增加农民的收入。我国目前的户籍制度，强化了城里人和乡村人的身份等级色彩。这种限制不仅不是市场化改革的任何制度创新，而只能是户籍制度和就业体制改革进程的一种倒退。

(4)对城乡区别对待，实行不同的福利待遇。很多的福利待遇往往是只是针对城里人的，相对贫困的农民却被排除了在了福利保障之外。

(二)当前我国户籍制度改革存在的问题

(1)没有统一的管理标准。在户籍改革过程中，出现了农业户口、非农业户口、自理口粮户口以及“蓝印户口”、“红本户口”、“绿本户口”、“咖啡户口”等不同性质和不同形式并存的混乱现象；出现买卖户口的现象；出现了人户分离、空挂户口、双重户口和无户口人员的现象；出现了暂住期长达10～20年“暂住”人口现象等等。

(2)出现了新的不平等的问题。城镇居民随着住房、福利、医疗保险、劳动就业等体制改革，已丧失了原先享有的各种福利。农民则在宅基地审批、人口和计划生育政策等方面享有着优于城市居民的利益。由于土地转让中城区城郊农民可以获得颇为丰厚的收益，一些原来转成城镇居民的希望再转回农村户口，政府不得不严把“非转农”的关口。按属地化管理之后，当前最主要的问题是：①土地流转问题。农民可以保留承包土地的权利，带土进城，享有城镇居民的同等待遇。②撤村建居后的土地利益分配问题。原来“城中村”的土地已经盖店铺厂房出租，村民可以分红利。取消“城中村”后，村民成为居民，仍要享用这项福利。⑧如何统一城乡计生政策的问题。过去的计生政策是按农村居民和城镇居民不同身份制定的，农村人可生二胎，城市人只准生一胎。计生管理上，城市管得严，农村管得松，城乡结合部往往是空白点。户籍改革后，随之带来了农村与城市计生政策如何统一的问题，当务之急是得有新的措施出台。

(3)城市资源的短缺问题首先在教育上反映出来了。子女的教育问题向来为中国家庭的头等大事，是人口迁徙的主要理由。以石家庄为例，由于一下子放开的口子太大，石家庄的中小学马上感到了教育资源的紧张。我们在浙江调查的情况看，对农民进城的首要限制因素已经不再是住房、就业，而在于城镇的教育容量。城镇所在地的学校，一般教育质量较高。农民进城居住的主要因素，就是要让孩子受到比乡间更好的教育，这就必然要挤压城镇原居民的教育资源。这里还有一个高考地区分数差的问题。

(4)城镇化中的区位差异因素更加突出了。从改革的情况来看，进城对外地人有吸引力，本地人对进城的兴趣不大。这种情况带有普遍性，不仅发生在小城镇、小城市，也包括大城市的郊区镇。以北京的试点镇户籍为例，与外来投资移民的热情形成鲜明对比的是，北京郊区本土本乡农民对城镇户口兴趣并不大。在试点镇的当地乡镇企业经营者和村民并不愿意把户口转向城镇，“农转非”和“村转镇”已经没有多大吸引力。本地人进城缺乏热情，原因主要是比较成本问题。到城镇搞生产经营成本较高，居住的限制较多，缴纳税费项目多，造成人们的望城却步。

(5)农民到大中城市落户的制度障碍依然存在。当前对农村居民全面开放的只是小城镇户口，条件是必须购买住房，这种以货币构筑的新门槛对普通农民来说仍然是难以逾越的。通过这一轮改革，居住和迁徙自由可以在小城镇基本得到实现。但人们真正想迁徙的地方是大城市和特大城市。由于大多数大城市和特大城市的门槛仍然很高，因此，许多人担心会形成农村、小城镇，小城市和大城市、特大城市的新的二元分割结构。

(6)户籍制度改革与其他相关改革不配套的矛盾，致使户籍制度改革举步维艰，难以到位。户籍制度改革的方向性目标，在于淡化以户籍管理为形式的人口流动控制，促进农村人口向城镇流动，从而加快城镇化进程。但是，由于其他相关改革不配套，却又反过来强化了户籍的重要性。最明显的例子如就学制度，以本地户口作为招生的先决条件，从根本上强化了户籍的重要性；再如就业制度中对户籍条件的要求，社会保障制度中户口作为限定条件，如此等等都程度不同地强化了户籍的重要性。可以说，倘若这些配套改革未能跟上去，通过户籍制度改革来促进城镇化的设想将难以收到预期的效果。