基础医学院主要承担医学类本科、研究生各专业及留学生的前期医学基础课程教学；目前设有18个教学、科研和管理机构；有专兼职教职工87人，其中正高级专业技术人员21人；设备总值达1400余万元。学院综合实力较强，拥有2个省级重点学科、1个省级重点专业、1个省级特色专业、1个省级新增博士学位建设项目建设点、1个省高校重点实验室、1个省高校示范实验室、2门省级精品课程、1个省高校优秀教学团队。学院的专业技术人员先后主持承担了包括国家自然科学基金、云南省自然科学基金和云南省科技创新强省重点项目在内的70余项科研项目，在国内外学术刊物发表各种学术研究论文1000余篇，出版教材和教学参考书30余部。
医学检验专业（本科五年）：培养从事医学检验工作，掌握医学基本理论与实验操作技能，具有较强科学思维和分析解决问题能力的高级人才。主要课程：分析化学、仪器分析、医学寄生虫学与检验、临床生化检验、临床免疫、微生物及检验、临床检验学等。学位授予：医学学士。就业方向：各级各类医疗卫生机构。