为适应研究型大学建设要求，培养优秀拔尖创新型高素质人才，学校设立了金善宝实验班。实验班是本硕连读优秀人才培养计划班，主要有经济管理、植物生产和动物生产三类学科专业。实验班从每年新生中通过考试择优选拔，按照“3+3”贯通本科和研究生教育的培养模式开展教育教学工作。学生在前3个学年按“加强基础、拓宽专业面”的原则完成本科阶段教学，经滚动和终选，被确定为本硕连读的学生后3个学年可选择专业方向，直接进入研究生阶段学习。

金善宝实验班(经济管理类)：依托南京农业大学农业经济管理和土地资源管理两个国家级重点学科在科学研究和人才培养方面的优势和条件而设立，对拔尖人才进行重点培养，因材施教，鼓励个性发展和特长发挥。实验班课程单独设置，以创新创业和国际化为目标，突出创新性和复合性;以实体班形式运行，全程实行学分制教学管理，科学有效。