| 序号 | 学科名称 | 学科类别 | 学科负责人 | 批准部门 |
| 1 | 海洋科学 | “十二五”省重中之重学科 | 吴常文 | 浙江省教育厅 |
| 2 | 海洋渔业科学与技术 | 第二批省重中之重学科 | 张秀梅 | 浙江省教育厅 |
| 3 | 生物化学与分子生物学 | “十二五”省重点学科 | 石戈 | 浙江省教育厅 |
| 4 | 水产（海洋科学） | “十二五”省重点学科 | 俞存根 | 浙江省教育厅 |
| 5 | 水产品加工及贮藏工程 | “十二五”省重点学科 | 邓尚贵 | 浙江省教育厅 |
| 第五批增列省重点学科B | ||||
| 6 | 海洋生物医药 | “十二五”省重点学科 | 丁国芳 | 浙江省教育厅 |
| 7 | 船舶与海洋工程 | 省“十二五”重点学科 | 谢永和 | 浙江省教育厅 |
| 8 | 油气储运工程 | “十二五”省重点学科 | 陈英 | 浙江省教育厅 |
| 9 | 船舶与海洋结构物设计制造 | 第五批增列省重点学科A | 谢永和 | 浙江省教育厅 |
| 10 | 海洋生物学 | 第五批省重点学科A | 吴常文 | 浙江省教育厅 |
| 11 | 行政管理学 | 第五批省重点学科B | 黄建钢 | 浙江省教育厅 |